Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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