Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR49Q8IV35 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms