Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C17orf58Q2M2W7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms