Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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