Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA2P26232 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms