Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms