Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.5 ms