Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SMAD6O43541 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SMAD6O43541 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SMAD6O43541 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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