Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms