Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms