Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
RETNLBQ9BQ08 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms