Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYNGAP1Q96PV0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms