Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIRT1Q96EB6 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms