Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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