Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP1Q86W92 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms