Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms