Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ERVFRD-1P60508 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms