Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH8P55286 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH8P55286 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH8P55286 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms