Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MTHFRP42898 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFRP42898 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFRP42898 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms