Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGP37231 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms