Protein–RNA interactions for Protein: P21964

COMT, Catechol O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTP21964 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COMTP21964 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COMTP21964 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COMTP21964 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms