Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms