Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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