Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms