Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 LIAS-204ENST00000424936 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms