Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PHF3Q92576 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PHF3Q92576 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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