Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPPQ6IPU0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms