Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRIP1Q5VSL9 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms