Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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