Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RTN1Q16799 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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