Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.1 ms