Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms