Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX1P83916 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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