Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JAG1P78504 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JAG1P78504 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JAG1P78504 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
JAG1P78504 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JAG1P78504 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JAG1P78504 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JAG1P78504 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms