Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LHX1P48742 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LHX1P48742 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LHX1P48742 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms