Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFNP31947 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFNP31947 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms