Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms