Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPM2P07951 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPM2P07951 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms