Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TYMSP04818 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TYMSP04818 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms