Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms