Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3QRK9 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3QRK9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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