Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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