Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms