Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
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