Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HES3Q5TGS1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms