Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms