Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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