Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms