Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms