Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms